Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACD3Q9P035 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACD3Q9P035 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACD3Q9P035 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms