Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLGN3Q9NZ94 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLGN3Q9NZ94 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLGN3Q9NZ94 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms