Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNK4Q9NYG8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNK4Q9NYG8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms