Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM53CQ9NYF3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM53CQ9NYF3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM53CQ9NYF3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM53CQ9NYF3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM53CQ9NYF3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM53CQ9NYF3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms