Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRNAU1APQ9NX07 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRNAU1APQ9NX07 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRNAU1APQ9NX07 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRNAU1APQ9NX07 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRNAU1APQ9NX07 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRNAU1APQ9NX07 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRNAU1APQ9NX07 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRNAU1APQ9NX07 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRNAU1APQ9NX07 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRNAU1APQ9NX07 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRNAU1APQ9NX07 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRNAU1APQ9NX07 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRNAU1APQ9NX07 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRNAU1APQ9NX07 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNAU1APQ9NX07 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRNAU1APQ9NX07 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRNAU1APQ9NX07 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.4 ms