Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU7

SDAD1, Protein SDA1 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDAD1Q9NVU7 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 CDC42BPA-209ENST00000448940 7355 ntTSL 1 (best)5.58□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 CADM1-214ENST00000543249 565 ntTSL 45.55□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 CDC42BPA-213ENST00000488131 1859 ntTSL 55.18□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 AP2B1-204ENST00000589774 552 ntTSL 44.5□□□□□ -1.698e-12■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 AP2B1-210ENST00000593014 577 ntTSL 44.37□□□□□ -1.718e-12■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 CDC42BPA-207ENST00000441725 2183 ntTSL 53.78□□□□□ -1.82e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 RNF19A-206ENST00000519527 817 ntTSL 33.78□□□□□ -1.82e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.842e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 CADM1-217ENST00000545094 581 ntTSL 33.51□□□□□ -1.852e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 JMJD1C-203ENST00000402544 8011 ntTSL 1 (best)2.58□□□□□ -22e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 GK-206ENST00000425166 371 ntTSL 52.44□□□□□ -2.022e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 JMJD1C-201ENST00000327520 3781 ntTSL 21.84□□□□□ -2.112e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.212e-6■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 GSE1-204ENST00000411612 872 ntTSL 520.25■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 39.6
SDAD1Q9NVU7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.012e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 ZNF598-206ENST00000564824 2147 ntTSL 525.43■■□□□ 1.662e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 324.49■■□□□ 1.512e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 EIF4G3-206ENST00000411888 1122 ntTSL 523.94■■□□□ 1.422e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 EIF4G3-208ENST00000438975 1270 ntTSL 519.15■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 TIAL1-211ENST00000489822 2222 ntTSL 216.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.251e-10■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.21e-10■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 TIAL1-213ENST00000497671 2321 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.121e-10■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 ABCA7-217ENST00000533574 587 ntTSL 415.1■□□□□ 0.011e-10■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 EIF4G3-213ENST00000634778 1343 ntTSL 214.03□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 CYBA-207ENST00000566534 1006 ntTSL 513.12□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 CYBA-206ENST00000566229 405 ntTSL 313.12□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 CYBA-205ENST00000565588 221 ntTSL 210.23□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 39.3
SDAD1Q9NVU7 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 38.6
SDAD1Q9NVU7 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 38.6
SDAD1Q9NVU7 NDUFS2-211ENST00000483804 1062 ntTSL 511.11□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 38.5
SDAD1Q9NVU7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.264e-10■■■■■ 38.5
SDAD1Q9NVU7 PKP4-210ENST00000480171 2772 ntTSL 29.08□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 38.3
SDAD1Q9NVU7 PKP4-216ENST00000495123 580 ntTSL 58□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 38.3
SDAD1Q9NVU7 PKP4-212ENST00000483881 452 ntTSL 23.01□□□□□ -1.931e-6■■■■■ 38.3
SDAD1Q9NVU7 CPE-204ENST00000511992 563 ntTSL 56.84□□□□□ -1.316e-7■■■■■ 38.2
SDAD1Q9NVU7 CPE-202ENST00000431967 633 ntTSL 46.63□□□□□ -1.356e-7■■■■■ 38.2
SDAD1Q9NVU7 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 37.4
SDAD1Q9NVU7 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.281e-8■■■■■ 37.4
SDAD1Q9NVU7 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 37.4
SDAD1Q9NVU7 ATP7B-205ENST00000418097 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 37.4
SDAD1Q9NVU7 ATP7B-211ENST00000634308 4321 ntTSL 1 (best)10.47□□□□□ -0.731e-8■■■■■ 37.4
SDAD1Q9NVU7 ATP7B-204ENST00000400370 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 37.4
SDAD1Q9NVU7 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.751e-8■■■■■ 37.4
SDAD1Q9NVU7 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.89e-8■■■■■ 37.4
SDAD1Q9NVU7 ATP7B-215ENST00000634844 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 37.4
SDAD1Q9NVU7 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.423e-6■■■■■ 37.4
SDAD1Q9NVU7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.664e-6■■■■■ 37.3
SDAD1Q9NVU7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.324e-6■■■■■ 37.3
SDAD1Q9NVU7 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 37.2
SDAD1Q9NVU7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 37.1
SDAD1Q9NVU7 GSE1-216ENST00000637419 2683 ntTSL 520.91■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 36.9
SDAD1Q9NVU7 GSE1-215ENST00000635906 666 ntTSL 312.02□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 36.9
SDAD1Q9NVU7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.714e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.514e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.394e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.364e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.234e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 PREB-206ENST00000444452 2030 ntTSL 1 (best)22.75■■□□□ 1.234e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.884e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.764e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 PREB-208ENST00000468045 3057 ntTSL 218.92■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.544e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 MYADM-207ENST00000421337 1009 ntTSL 216.9■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 KIFC2-203ENST00000529864 320 ntTSL 516.84■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.274e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.254e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 KIAA0319L-216ENST00000482929 1524 ntTSL 216.29■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 AXIN2-204ENST00000577278 976 ntTSL 515.99■□□□□ 0.152e-11■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 MARCH6-211ENST00000512449 832 ntTSL 514.79□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 RRP12-209ENST00000490815 529 ntTSL 314.36□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 CES2-203ENST00000561697 918 ntTSL 314.21□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.24e-6■■■■■ 36.8
SDAD1Q9NVU7 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.254e-6■■■■■ 36.8
Retrieved 100 of 11,671 protein–RNA pairs in 222.9 ms