Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETD4Q9NVD3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD4Q9NVD3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD4Q9NVD3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms