Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZDHHC18Q9NUE0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZDHHC18Q9NUE0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC18Q9NUE0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC18Q9NUE0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms