Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOMER3Q9NSC5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOMER3Q9NSC5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER3Q9NSC5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOMER3Q9NSC5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOMER3Q9NSC5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms