Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLSCR3Q9NRY6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLSCR3Q9NRY6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms