Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BIN3Q9NQY0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BIN3Q9NQY0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BIN3Q9NQY0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms