Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NLRC4Q9NPP4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRC4Q9NPP4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRC4Q9NPP4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRC4Q9NPP4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRC4Q9NPP4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms