Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRCC1Q9NPI7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
KRCC1Q9NPI7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRCC1Q9NPI7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms