Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP86

CABP5, Calcium-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP5Q9NP86 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CABP5Q9NP86 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CABP5Q9NP86 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms