Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARFGAP3Q9NP61 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARFGAP3Q9NP61 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGAP3Q9NP61 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms