Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD248Q9HCU0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CD248Q9HCU0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD248Q9HCU0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD248Q9HCU0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms