Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CBX8Q9HC52 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX8Q9HC52 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CBX8Q9HC52 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CBX8Q9HC52 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms