Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS7BQ9H9Q2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS7BQ9H9Q2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS7BQ9H9Q2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPS7BQ9H9Q2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPS7BQ9H9Q2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPS7BQ9H9Q2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS7BQ9H9Q2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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