Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HIPK3Q9H422 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIPK3Q9H422 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HIPK3Q9H422 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms