Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MFSD1Q9H3U5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MFSD1Q9H3U5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MFSD1Q9H3U5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MFSD1Q9H3U5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MFSD1Q9H3U5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MFSD1Q9H3U5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MFSD1Q9H3U5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MFSD1Q9H3U5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MFSD1Q9H3U5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MFSD1Q9H3U5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD1Q9H3U5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MFSD1Q9H3U5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD1Q9H3U5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms