Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EHD4Q9H223 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
EHD4Q9H223 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EHD4Q9H223 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
EHD4Q9H223 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EHD4Q9H223 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms