Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MKRN2Q9H000 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKRN2Q9H000 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN2Q9H000 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN2Q9H000 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN2Q9H000 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN2Q9H000 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN2Q9H000 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN2Q9H000 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN2Q9H000 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN2Q9H000 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN2Q9H000 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN2Q9H000 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN2Q9H000 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms