Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CIPCQ9C0C6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CIPCQ9C0C6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CIPCQ9C0C6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CIPCQ9C0C6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CIPCQ9C0C6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms