Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SETD2Q9BYW2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SETD2Q9BYW2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SETD2Q9BYW2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms