Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GSDMCQ9BYG8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSDMCQ9BYG8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMCQ9BYG8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMCQ9BYG8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms