Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RSPO3Q9BXY4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RSPO3Q9BXY4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSPO3Q9BXY4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms