Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SF3B5Q9BWJ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3B5Q9BWJ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3B5Q9BWJ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SF3B5Q9BWJ5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3B5Q9BWJ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3B5Q9BWJ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms