Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG6

SCNM1, Sodium channel modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNM1Q9BWG6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCNM1Q9BWG6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCNM1Q9BWG6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCNM1Q9BWG6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNM1Q9BWG6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms