Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A23Q9BV35 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A23Q9BV35 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A23Q9BV35 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A23Q9BV35 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A23Q9BV35 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A23Q9BV35 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A23Q9BV35 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A23Q9BV35 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A23Q9BV35 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC25A23Q9BV35 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC25A23Q9BV35 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC25A23Q9BV35 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC25A23Q9BV35 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC25A23Q9BV35 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC25A23Q9BV35 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A23Q9BV35 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A23Q9BV35 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms