Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKNK1Q9BUB5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKNK1Q9BUB5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MKNK1Q9BUB5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKNK1Q9BUB5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms