Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFAF3Q9BU61 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDUFAF3Q9BU61 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFAF3Q9BU61 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms