Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLSTN3Q9BQT9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CLSTN3Q9BQT9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN3Q9BQT9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN3Q9BQT9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms