Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNKPQ96T60 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNKPQ96T60 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PNKPQ96T60 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNKPQ96T60 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNKPQ96T60 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms