Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX1Q96RV3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PCNX1Q96RV3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNX1Q96RV3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNX1Q96RV3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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