Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD4LQ96PU5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD4LQ96PU5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4LQ96PU5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4LQ96PU5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms