Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
ARAP1Q96P48 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ARAP1Q96P48 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ARAP1Q96P48 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ARAP1Q96P48 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ARAP1Q96P48 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ARAP1Q96P48 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ARAP1Q96P48 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ARAP1Q96P48 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ARAP1Q96P48 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
ARAP1Q96P48 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
ARAP1Q96P48 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ARAP1Q96P48 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ARAP1Q96P48 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
ARAP1Q96P48 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
ARAP1Q96P48 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
ARAP1Q96P48 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ARAP1Q96P48 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARAP1Q96P48 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
ARAP1Q96P48 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms