Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCMTD1Q96MG8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCMTD1Q96MG8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PCMTD1Q96MG8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PCMTD1Q96MG8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms