Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PRAC1Q96KF2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PRAC1Q96KF2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PRAC1Q96KF2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms