Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLPTM1LQ96KA5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLPTM1LQ96KA5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLPTM1LQ96KA5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLPTM1LQ96KA5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms