Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC41A2Q96JW4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC41A2Q96JW4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC41A2Q96JW4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC41A2Q96JW4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms