Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SHDQ96IW2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHDQ96IW2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHDQ96IW2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHDQ96IW2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHDQ96IW2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms