Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAX2Q96IS3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAX2Q96IS3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAX2Q96IS3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms