Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNF185Q96GF1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNF185Q96GF1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms