Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFT43Q96FT9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT43Q96FT9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT43Q96FT9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT43Q96FT9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms