Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC10A4Q96EP9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC10A4Q96EP9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC10A4Q96EP9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC10A4Q96EP9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC10A4Q96EP9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms