Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM44Q96DX7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM44Q96DX7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM44Q96DX7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM44Q96DX7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms