Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERP27Q96DN0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ERP27Q96DN0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms