Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NSUN4Q96CB9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NSUN4Q96CB9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NSUN4Q96CB9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NSUN4Q96CB9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NSUN4Q96CB9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms