Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ULK4Q96C45 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK4Q96C45 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ULK4Q96C45 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms