Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHD2Q96C19 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHD2Q96C19 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD2Q96C19 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHD2Q96C19 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHD2Q96C19 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms